CDD Ingénieur séquençage haut débit NGS H/F
CDD Évry-Courcouronnes (Essonne) Développement informatique
Description de l'offre
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachement
Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.
Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.
Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :
• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité
Référence
2024-32823Description de la Direction
Au sein de la Direction de la Recherche Fondamentale, l'Institut de biologie François Jacob, développe des recherches fondamentales, translationnelles et technologiques en radiobiologie et radiotoxicologie ; santé humaine (affections neurodégénératives, infectieuses et immunohématologiques) et génomique médicale et environnementale.
Description de l'unité
L'institut JACOB regroupe plusieurs départements dont le Genoscope et le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) situés à Evry. Ces départements mènent des projets de recherche propres et produisent des données de séquençage à haut-débit pour des projets collaboratifs hautement compétitifs.
Le CNRGH qui fait partie de cet institut est le centre national de recherche français qui permet de répondre aux questions scientifiques nécessitant des besoins de séquençage et de génotypage à haut débit grâce au développement et à la mise en œuvre de technologies innovantes et intégrées. L'organisation du CNRGH permet d'optimiser la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines, en créant les liens indispensables entre la constitution des cohortes (échantillons d'ADN), l'identification des gènes responsables, l'étude du transcriptome et de l'épigénome.
Le CRefIX (Centre de REFérence, d'Innovation, d'eXpertise et de transfert) est, avec les plateformes de séquençage et le centre d'analyse de données, une des trois structures clés du Plan France Médecine Génomique 2025 (FMG 2025) visant à déployer l'analyse génomique dans l'offre de soins. Le CRefIX est hébergé au sein du Centre National de Recherche en Génomique Humaine.
Le CNRGH est implanté à Evry (91), 30 km au sud de Paris.
Description du poste
Domaine
Biologie, biophysique et biochimie
Contrat
CDD
Intitulé de l'offre
CDD Ingénieur séquençage haut débit NGS H/F
Statut du poste
Cadre
Durée du contrat (en mois)
12
Description de l'offre
Au sein du CRefIX, vous aurez comme mission principale l’évaluation ou la mise en œuvre de protocoles adaptés aux échantillons biologiques complexes (échantillons FFPE, microbiopsies, ctDNA, etc.), l’évaluation de nouveaux séquenceurs ou encore de robot pour l’automatisation de préparations de
librairies NGS.
Vous assurerez les missions suivantes, dans un premier temps en parallèle, puis pleinement :
- rédaction et suivi de procédures d’exploitation normalisées (SOP, standard operating procédures) pour le séquençage « humide », de l’extraction des acides nucléique au séquençage proprement dit ;
- tests et veille technologique et technique (évaluation de nouveaux kits d’extraction, de kits de préparation de librairie, évaluation de nouveaux séquenceurs (technologies long read, technologies dites multi-omiques, etc.);
- évaluation des solutions technologiques existantes (évaluation de nouveaux kits d’extraction, de kits de préparation de librairie, de nouveaux automates (miniaturisation par exemple), évaluation de nouveaux séquenceurs (technologies long read, technologies dites multi-omiques, etc.).
Merci d'envoyer votre candidature à Mme TURON Violette : vturon@cnrgh.fr
Profil recherché
Profil du candidat
Formation
Titulaire d’une thèse ou d’un diplôme d’Ingénieur en biologie moléculaire, vous possédez de solides connaissances en biologie moléculaire et une expérience confirmée en NGS, de préférence appliquée à la génomique humaine (maladies rares et cancer).
Compétences Requises
Aptitudes :
- dynamisme et curiosité ;
- esprit de synthèse ;
- sens de l’organisation, rigueur, respect des règles ;
- bon relationnel ;
- rigueur et autonomie ;
- capacités à communiquer au sein d'équipes pluridisciplinaires ;
- savoir présenter ses résultats à l’oral et par écrit en français et anglais.
Connaissances techniques :
- Compréhension de la problématique scientifique ;
- connaissances théoriques et pratiques approfondies en biologie moléculaire, préparation de librairies et séquençage haut débit (NGS) (WGS, WES, RNA-Seq) ;
- connaissance de la robotique associée à la préparation de librairies et au séquençage de haut débit ;
- capacités rédactionnelles techniques et scientifiques ;
- anglais courant requis.