Le candidat ou la candidate sera en charge des développements de modèles de tumoroïdes clonaux issus de résections (patient-derived organoids, PDO). Sur la base du savoir-faire des équipes Biomics et LSMB, les cultures cellulaires 3D seront produites par développement clonal au sein de microbilles de matrice extracellulaire reproduisant le microenvironnement physiologique des cellules. Les microbilles sont produites de façon semi-automatisé dans un instrument dédié.
Votre mission sera de mettre au point le protocole d’extraction et de sélection des cellules tumorales dans les échantillons de tumeur, et de produire les PDO clonaux correspondants dans les microbilles de matrice extracellulaire. Les sous-populations clonales seront ensuite isolées, amplifiées et caractérisées sur la base de leurs génotypes et phénotypes pour étudier la variabilité des réponses des différentes sous-populations clonales à l’exposition de composés pharmaceutiques. Votre contribution aux avancées de l’équipe portera sur la constitution d’une biobanque de modèles PDO caractérisés et la réalisation et la qualification de tests de composés sur des modèles de tumeurs mono- et multi-patients.

Bibliographie :
M. E. Dolega et al., Biomaterials, 2015, 52, 347-357.
B. Laperrousaz et al., Nucl. Acids Res., 2018, 46, e70.
S. Porte et al., Proc. European Organ-On-Chips Society (EUROoCS), p. 342, Milan, Italie, 2024.

Travail demandé :
- Extraction et sélection des cellules tumorales dans des échantillons de patients.
- Production de tumoroïdes clonaux encapsulés dans des microbilles de matrice extracellulaire.
- Tri, isolation et amplification des sous-populations clonales.
- Caractérisation des mutations et des phénotypes de chaque sous-population clonale.
- Conservation des clones des tumeurs des patients dans une biobanque.
- Développement de modèles standardisés de la tumeur des patients.
- Tests toxicologiques de composés thérapeutiques et de biothérapies sur les modèles de tumeur.