Stage Master 2 bio-informatique (H/F)

Description de l'offre

Description du poste

Famille de métier

R & D - Développement projets

Type de contrat

Stage

Temps de travail

Temps complet

Finalité du poste

Intégré(e) dans l'équipe de Bioinformatique et Biostatistique de La Bohalle, et en interaction étroite avec les équipes R&D de la société, vous réaliserez le développement d'un pipeline d'analyse de données NGS et de son déploiement au sein de la plateforme Galaxy de l'entreprise. Celui-ci s'intégrera dans la mise en place d'un processus d'optimisation de l'identification de variant d'intérêt agronomique.

Missions

Les principales missions de ce stage viseront à :
- Interagir avec les équipes impliquées pour mettre en place un workflow adaptés aux besoins.
- Participer au développement des outils et interfaces nécessaires au pipeline que vous aurez identifié.
- Veiller au respect des bonnes pratiques de développement permettant de faciliter la maintenance des outils réalisés.
- Communiquer avec les utilisateurs pour intégrer au mieux vos développement dans les processus déjà en place.
- Travailler au sein d'une équipe et communiquer efficacement avec des personnes aux profils variés.

Profil

Profil Etudiant en M2 de bioinformatique, vous avez des connaissances en génomique et génétique. Une maitrise correcte du langage python est attendue. Des connaissances de l'environnement Galaxy, de l'utilisation de Git et d'Unix seront les bienvenues.

Vos qualités d'organisation, votre autonomie, et vos compétences personnelles vous permettront de mener à bien ce stage dans un environnement dynamique et pluridisciplinaire.

Localisation du poste

Localisation du poste

Europe, France, Pays de Loire, Maine et Loire (49)

Lieu

38 Les Ronzières, 49800 La Bohalle, France

Critères candidat

Niveau d'études min. requis

Master ou équivalent

Niveau d'expérience min. souhaité

Non renseigné

Demandeur

Poste à pourvoir le

03/02/2020